CÍLENÉ STANOVENÍ PRIVÁTNÍ MUTACE LIDSKÉHO GERMINÁLNÍHO GENOMU
K analýze privátní mutace se obvykle používá sekvenování jednoho amplikonu lidského germinálního genomu. Syntéza nových primerů je u tohoto typu vyšetření vždy součástí kalkulace. Jedná-li se o ověření mutace u probanda, používají se primery odlišné od původních, kterými byla zjištěna mutace specifická pro rodinu.
+31 bodůoproti 2025
Vývoj v čase
- Nositelé výkonu
- Kategorie úhrady
- Kategorie: P – hrazen plně
- Doba výkonu
- 90 min
- Čas nositele VZP
- 90
- Typ formuláře
- Ambulantní
- Frekvenční omezení
- 10/1 rok
- Omezení místem
- S – pouze na specializovaném pracovišti
Poznámka
Zjištění privátní mutace se typicky provádí u příbuzných probanda, u něhož byla předchozími vyšetřeními zjištěna vzácná genetická varianta se závažnými fenotypovými projevy. Dále vyšetření slouží k ověření mutace u probanda z nového vzorku jiným postupem. Nahrazuje výkon 94123. Zařazení nového výkonu odstraní nepřehledné vykazování molekulárně genetických vyšetření opakovaným vykazováním výkonů založených na PCR technologii bez ohledu na skutečně použitou techniku a charakter genomové varianty (germinální x somatický genom). K výkonu je možné alternativně využít NGS přístroje (přístrojové vybavení včetně ceny viz výkon č. 94365). V případě obou metod kalkulace výkonu odpovídá (souhrnně – přístroj, PMAT, čas výkonu a nositele).
Průběh výkonu
Zahájení
Stanovením strategie vyhledávání mutace pomocí sekvenování, restrikční analýzy nebo pomocí metody ARMS-PCR a návrhem primerů. Syntéza nových primerů je u tohoto typu vyšetření vždy součástí kalkulace.
Průběh
Sekvenování jednoho amplikonu: Amplifikace PCR, přečištění PCR produktu, kontrola množství a kvality PCR produktů agarosovou elektroforézou (včetně fotodokumentace) a měření koncentrace DNA na spektrofotometru, vlastní sekvenační reakce na obou vláknech DNA, přečištění obou sekvenačních reakcí kitem, separace fragmentů na kapilárním sekvenátoru. Alternativně obohacení o vybrané úseky genomu, označení identifikačními sekvencemi a sekvenační reakce metodou NGS. Vyhodnocení sekvence na obou vláknech. V některých konkrétních případech lze použít alternativní metody:
Ukončení
Vydáním zprávy a archivací výsledku.
Materiály (1)
- 2 851,97 bodů
Přístroje (2)
- 682,73 bodů
- 122,89 bodů